Tras la explosión, la estructura del reclusorio sufrió daños considerables. Cabe señalar que un suceso similar ocurrió un año antes y exactamente en esta misma penitenciaría. La explosión de ese entonces obligó a las autoridades a trasladar a varios presos de alta peligrosidad hacia otras instalaciones carcelarias.
La explosión sucedió a las 10:45 a. m., hora local de Ecuador, esto después de que el drone aterrizara a tempranas horas en el centro. El Gobierno manifestó que, en un primer momento, se habría logrado frustrar el atentado que buscaba inhabilitar la prisión, misma que alberga a 12 mil reos, entre ellos destacaría Jorge Glas, exvicepresidente de Ecuador.